一种燃料电池堆的热管理系统,其特征在于,包括：燃料电池堆、流量控制单元和第一热交换器；所述燃料电池堆通过第一管路与所述流量控制单元相连,所述燃料电池堆通过第二管路与所述第一热交换器相连；所述流量控制单元用于在所述燃料电池堆的温度小于第一温度阈值时,控制所述第一管路导通,使流经所述燃料电池堆的冷却液按第一循环回路运行；所述流量控制单元还用于在所述燃料电池堆的温度大于所述第一温度阈值时,控制所述第二管路导通,使流经所述燃料电池堆的冷却液按第二循环回路运行。