一种基于独立电池组的电池箱热管理系统,其特征在于其包括：电池箱,其包括动力电池组和热管理电池组,该动力电池组提供动力电源,该热管理电池组提供电池热管理所需电源,该热管理电池组具有独立于该动力电池组的正极端子和负极端子；导热水室,内部具有供导热介质流动的导热介质管道,该导热水室与该动力电池组和该热管理电池组导热连接；充电接口电路,与该热管理电池组的正负极端子电连接,该充电接口电路用于连接外部电源；温度调节部,与该导热水室连通,用于调节该导热介质的温度；以及整车控制器,与该电池箱、该充电接口电路、该温度调节部信号连接；接收该热管理电池组的电量信息控制该充电接口电路的接通与关闭；接收该电池箱的温度信息控制该温度调节部调节导热介质的温度；其中,该热管理电池组为该温度调节部、该整车控制器提供电源。