一种燃料电池发电系统,其特征在于,包括：一重组物质供应器,输出一重组物质；一第一热调节装置,与所述重组物质供应器连接,并接收所述重组物质；一重组装置,具有一重组器及一加热器,所述重组器与所述第一热调节装置连接,接收所述重组物质并输出一气体流至所述第一热调节装置；一燃料电池堆,与所述第一热调节装置及所述加热器连接,并接收所述气体流；以及一第二热调节装置,与所述燃料电池堆及所述第一热调节装置连接。