一种高温质子交换膜燃料电池系统热管理方法,所述燃料电池系统包括电堆或燃料电池(1)、以及冷却介质循环子系统,其特征在于：所述冷却介质循环子系统包括换热器(3)、循环液储箱(4)和循环泵(5)；循环泵(5)的入口通过管路与循环液储箱(4)的出口相连,循环泵(5)的出口通过管路与电堆或燃料电池(1)冷却腔入口相连,换热器(3)的高温介质入口通过管路与电堆或燃料电池(1)冷却腔出口相连,换热器(3)的高温介质出口通过管路与循环液储箱(4)相连；在换热器(3)的低温介质入口通入低温介质,并由低温介质出口流出；所述循环液储箱(4)充有冷却介质作为循环液,所述循环液为沸点高于电堆或燃料电池操作温度的液体,所述电堆或燃料电池操作温度为100?200℃。